Capitulo 1: Los aminoácidos naturales

• Introducción
• Aminoácidos hidrofóbicos alifáticos
• Aminoácidos hidrofóbicos aromáticos
• Aminoácidos polares neutros
• Aminoácidos Acidos
• Aminoácidos Básicos
• Aminoácidos de importancia conformacional
• Propiedades de los aminoácidos

Capítulo 2: Conformación de las cadenas laterales y enlace peptídico

• Nomenclatura y conformación
• Enlace peptídico

Capitulo 3: Estructura Secundaria y Conformación del Esqueleto

• Angulos de torsión
• Gráfico de Ramachandran
• Estructura secundaria
• La a-hélice
• Desarrollo de un modelo de estructura de a-hélice
• Propiedades de la a-hélice
• Distorsiones en la a-hélice
• La hélice 3₁₀
• La estructura b
• Hojas-b paralelas, anti-paralelas y mixtas
• Vueltas reversas

Capítulo 4 : Estructuras secundaria superior

• La horquilla beta
• La horquilla beta con vuelta de dos residuos
• La horquilla beta con vuelta de tres residuos
• La horquilla beta con vuelta de cuatro residuo
• Serpenteo Beta
• Esquinas Betas
• Horquilla alfa o helicoidales
• Esquinas alfa - alfa
• Hélice - vuelta - hélice
• Motivo beta - alfa - beta

Capítulo 5: Estructura terciaria y plegamientos

• Introducción
• Topologías helicoidales
• Hélices aisladas
• Motivo Hélice - vuelta - Hélice
• El paquete de cuatro hélices
• Globulinas
• Empaquetamiento hélice - hélice
• Algunos plegamientos todo-alfa
• Topologías todo- Beta
• Sandwiches betas y Barriles betas
• Sandwiches betas alineados y ortogonales
• Barriles betas
• Topología de la clave griega
• Topología del remolino o "Jellyroll"
• Otros Plegamientos
• Topologías alfa/beta
• Plegamiento de Rossman
• Herradura alfa/beta
• Barriles alfa/beta
• Topologías alfa + beta
• Plegamientos ricos en puentes disulfuros, proteínas pequeñas

Capítulo 6: Estructura cuaternaria

• Heteromultímero
• Homomultímero
• Grandes agregados macromoleculares

Apendice A : Lecturas recomendadas

• Libros
• Artículos de revistas

Apendice B : Algunas direcciones de Internet útiles para estudios en estructura de proteínas

• Principales bases de datos de secuencias
• Principales bases de datos de estructuras 3D