PRINTS (database fingerprint (Huellas dactilares) de proteínas)
SWISS-PROT (secuencias de proteínas y herramientas)
PROSITE (sitios funcionales en proteínas)
Database de Secuencias de Proteínas PIR-International
DALI compara estructuras de proteínas en 3D
3Dee (database de definiciones dominios de proteínas structure)
NRL-3D (database de secuencias de derivedas del PDB)
HSSP (estructure secundaria de proteínas obtenidas por homología)
FSSP (clasificación del plegamiento basados en alineamientos estructura-estructura )
Brookhaven Protein Data Bank PDB
EBI Atlas de topología de Proteínas
SCOP (Clasificación Estructural de Proteínas), MRC
CATH: Clasificación Estructura de Proteínas