La existencia de sitios adscritos a la Conferencia supone la puesta en marcha de un plan de manejo de sus recursos. En el caso del Río Cruces, declarado santuario de la naturaleza, es la Conaf la institución encargada de administrar estos recursos; sin embargo problemas económicos y técnicos han retardado la implementación del plan, dice Schlater. Pero, a pesar de las limitaciones, se han emprendido algunas acciones aisladas dirigidas a algunas especies, como estudios de fauna a cargo del mismo Schlater. En opinión del académico, a pesar de las diversas funciones que cumplen los humedales, la conciencia sobre su conservación es mínima: en el caso de las personas la protección de estos sitios significa restar las posibilidades de explotación de los recursos; muchos proyectos de infraestructura vial se sitúan en áreas que limitan con estas zonas y ellas, según Schlater, tampoco están consideradas en ciertas políticas públicas como las de riego, por ejemplo.